Сила «Цербера» — сила каждого из людей. «Цербер» и есть человечество.

Предав «Цербер», Шепард со своим экипажем решил сдаться Альянсу. Но для Призрака куда хуже оказался тот факт, что за время пребывания на «Нормандии» многие опытные и верные сотрудники «Цербера» были «отравлены» идеалистическими убеждениями коммандера, который показал им, что организация не такая уж и благая. Келли Чамберс, Джейкоб Тейлор и многие другие ушли в самоволку вслед за Шепардом. Даже Миранда Лоусон, лучшая оперативница до этого момента, начала сомневаться в правильности идеалов «Цербера», а потому Призрак отстранил её от должности. Но не весь экипаж «Нормандии» был отравлен идеализмом капитана. Такие члены команды, как Руперт Гарднер, заведующий столовой на «Нормандии» SR-2, разочаровался в капитане и вернулся в организацию. Когда же коммандер Шепард сдался Альянсу, он был заключен под арест по обвинению в уничтожении ретранслятора «Альфа» в батарианской системе, что привело к взрыву, убившему всё население системы — около трёхсот тысяч душ. Оказалось, что ещё во время сотрудничества с «Цербером», Шепард тайно, даже не оповещая собственных напарников, по просьбе адмирала Хакетта отправился в батарианскую систему, где были найдены доказательства скорого прибытия Жнецов. Чтобы отсрочить неминуемое, Спектр уничтожил ретранслятор, таким образом замедлив Вторжение Жнецов в Млечный путь. Несмотря на предательство Шепарда, успех за ретранслятором Омега-4 принёс организации огромную славу на всю галактику. Слухи о Жнецах, о бездействии Совета, о победе над Коллекционерами вернули «Церберу» престиж и внимание. Влияние Призрака возросло настолько, что он впервые смог работать полуоткрыто, хотя и через подставные корпорации и управляемые группы. По сравнению с так называемыми террористами, Альянс и Совет в глазах общественности были робкими и нерешительными. «Цербер» использовал в своих целях интерес не только со стороны землян, но и граждан Цитадели, позиционируя себя как высококомпетентную и благородную организацию-мстителя, что, в свою очередь, значительно пополнило ряды и расширило возможности «Цербера». Несмотря на уничтожение базы Коллекционеров, организация продолжила изучение технологий Жнецов благодаря накопленным к этому моменту знаниям. Учёные искали способ усовершенствовать бойцов, чтобы получить солдат, превосходящих по мощи силы Альянса, турианцев, саларианцев. Данный процесс был назван интеграцией. Испытуемые получали на редкость впечатляющие физические улучшения, но побочным эффектом являлось полное изменение нейронных связей. — Усовершенствования были успешно внедрены, — отчитывалась учёная «Цербера». — Наши воины превосходят любого из солдат Альянса. — Продолжим внедрение, — одобрительно кивнул Призрак. — Я хочу, чтобы каждый солдат получил свои имплантаты до прибытия Жнецов. — Но я по-прежнему опасаюсь, что мы потеряем контроль над армией, — взволнованно продолжила учёная. — Некоторые из солдат уже слышат голоса. — Когда мы будем контролировать Жнецов, единственный голос, который они будут слышать — это наш. Интеграция позволила «Церберу» насильно обработать многих своих сотрудников и превратить ранее нейтрально или враждебно настроенных людей в фанатично преданных солдат. Исключением стали лишь её научный и офицерский состав. Несмотря на свои улучшения, солдат лишался какой-либо воли и самостоятельного мышления для принятия решений.

Личные записи рядового А. Мастерс, 1 день.

Вот я и тут. Бойцы суровые. Никто не улыбается. Вообще. Если возьмут в плен, велено убить себя. Вот так. Тренировки называют «интеграцией». Меня будут «интегрировать» завтра. Скорей бы уж.

Личные записи рядового А. Мастерс, 2 день.

Интеграция прошла успешно. Обещаю убить себя при попадании в плен. «Цербер» превыше всего. Мы защитим человечество. Любой ценой.

Интеграция позволила организации не только избавиться от сомневающихся и нелояльных, но и значительно расширить свои ряды, создав собственную армию, не уступающую силам Альянса и Совета. Беженцы, пострадавшие от Коллекционеров, ничего не подозревающие добровольцы или похищенные граждане Альянса становились верными пешками «Цербера». Благодаря своему скрытому влиянию среди военных подрядчиков Альянса, «Цербер» также смог скрыть приобретение большого флота военных кораблей, оснащенных технологиями Жнецов, что позволило ей стать одной из самых передовых в галактике. В пик своего могущества организация имела флот, состоящий из фрегатов, крейсеров и дредноутов. Он считался достаточно мощным, чтобы представлять серьёзную угрозу даже пронумерованным флотам Альянса. Несмотря на огромную армию и превосходную флотилию, «Цербер» не мог в открытую воевать с Альянсом и Советом, у которых войск было на порядок больше, чем у организации, даже несмотря на улучшения Жнецов. Тогда Призрак обратил своё внимание на Омегу — космическую станцию, которая была главным торговым и преступным центром в системах Терминус. Омега была известна во всей галактике как прибежище анархистов, наводненное бандитами, пиратами, всяким сбродом и наёмниками. Лидер «Цербера» знал, что ни Совет, ни Альянс не будет заступаться за такой контингент, что позволило ему оккупировать станцию и изгнать Арию Т’Лоак. Администратором Омеги был назначен генерал Олег Петровский, когда-то служивший обычным капралом в период Войны первого контакта. Захват Омеги позволил «Церберу» расширить влияние на все системы Терминус. Оккупацией Омеги организация в очередной раз продемонстрировала всей галактике, что пока Совет и Альянс бездействуют и сквозь пальцы смотрят на местных преступников и синдикаты, «Цербер» способен избавить жителей галактики от надоевших бандитов. На самой же Омеге был установлен жёсткий контроль. На все административные должности назначались только люди, даже оружие на станции имели право носить исключительно представители человечества. На предпринимателей-инопланетян налагались большие налоги, в отличии от тех же людей. Правление «Цербера» местные обыватели восприняли в штыки. Это способствовало развитию подпольных нелегальных организаций на Омеге, с легкостью вербующих представителей инопланетных рас в свои ряды, которые понимали, что «Цербер» не заинтересован в благополучии кого-либо, кроме людей. До вторжения Жнецов оставались считанные недели.